122 GAMBIT: Genomic Approximation Method for Bacterial Identification and Tracking
Manage episode 405579692 series 3381906
תוכן מסופק על ידי Micro Binfie Podcast and Microbial Bioinformatics. כל תוכן הפודקאסטים כולל פרקים, גרפיקה ותיאורי פודקאסטים מועלים ומסופקים ישירות על ידי Micro Binfie Podcast and Microbial Bioinformatics או שותף פלטפורמת הפודקאסט שלהם. אם אתה מאמין שמישהו משתמש ביצירה שלך המוגנת בזכויות יוצרים ללא רשותך, אתה יכול לעקוב אחר התהליך המתואר כאן https://he.player.fm/legal.
We discuss GAMBIT, software for accurately classifying bacteria and eukaryotes using a targeted k-mer based approach. GAMBIT software: https://github.com/gambit-suite/gambit GAMBIT suite: https://github.com/gambit-suite GAMBIT (Genomic Approximation Method for Bacterial Identification and Tracking): A methodology to rapidly leverage whole genome sequencing of bacterial isolates for clinical identification. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0277575 TheiaEuk: a species-agnostic bioinformatics workflow for fungal genomic characterization https://www.frontiersin.org/journals/public-health/articles/10.3389/fpubh.2023.1198213/full
…
continue reading
141 פרקים